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Ambos conferem títulos de mestre/a ou doutor/a, porém enquanto os mestrados e doutorados acadêmicos visam preparar, especialmente, professores e pesquisadores, os cursos na modalidade profissional enfatizam estudos e técnicas aplicados, visando a formação continuada e o aperfeiçoamento de profissionais com alto nível de qualificação para atuar, principalmente, no mercado de trabalho fora das áreas da ciência e educação.